PA tag
PA tagはヒトポドプラニンのPLAG配列を利用したペプチドタグ(GVAMPGAEDDVV)による日本発のアフィニティータグシステムです。 抗PA tag抗体(NZ-1)はPA tagに対して高い親和性と特異性を持ち、PA tag融合タンパク質を高純度かつワンステップで精製可能です。ウェスタンブロッティングやフローサイトメトリー、免疫細胞染色にも応用することもできます。
また抗PA tag抗体はPA tagのループ構造を認識でき、膜タンパク質の精製・検出にも適用可能です。
PA tag 基本情報
| タグ配列 | GVAMPGAEDDVV |
|---|---|
| 由来 | ヒトポドプラニンPLAG配列 |
| 残基数(aa) | 12 |
| 分子量(kDa) | 1.16 |
| 等電点(pI) | 3.49 |
| 抗体結合力(KD(M)) | 4.9 x 10-10 |
| 抗体 | モノクローナル抗体 |
| 免疫動物 | ラット |
| クローンNo. | NZ-1 |
特長
PA tagと抗PA tag抗体の高い親和性と特異性
複合体の構造
PA tagと抗PA tag抗体の結合は、他のアフィニティータグと比べて10 - 100倍も強いことが分かっています。理由として ①タグと抗体が結合するときに立体構造がほとんど変化しないこと、② PA tagはβターン構造をとり、その構造が抗体の認識部位にしっかりとはまりこんでいることが挙げられます。
タグと抗体の親和性(結合の強さ)を比較した実験において、PA tagはタグと抗体がほとんど解離しないことが分かっています。タグと抗体の結合力を示す解離平衡定数(KD値)は小さければ小さいほど、結合力が強いことを意味しますが、PA tagは4.9 x 10-10Mで他のアフィニティータグと比較してもかなり高いことが分かります。
タグと抗体の結合が強ければ、標的タンパク質を抗体でしっかりと捕捉することが可能で、より強い洗浄操作も行うことができます。このような強い結合を有するにも関わらず、ペプチド添加による競合溶出が可能であることはPA tagの興味深い特長の一つです。
中性条件でレジンの再生が可能
通常、抗体結合ビーズの再生には酸性バッファー(pH2.5〜3.5)が用いられますが、酸性バッファーは抗体にダメージを与えるため、再生の繰り返しによりタンパク質精製効率が低下します。
しかし抗PA tag抗体結合ビーズは専用の洗浄溶液を使用すれば、中性条件下で60回再生でき、タンパク質精製効率も低下しません。これによりタンパク質精製にかかるコストを抑えることができます。
- 洗浄溶液で完全に抗体からタグペプチドを除去できない場合もありますので、異なるタンパク質を精製する場合にはコンタミネーションにご注意してください。
ループ構造の認識が可能
PAペプチドの認識機構
既存の抗タグ抗体はペプチドタグの伸びた形を認識します。したがって多くのペプチドタグはタンパク質のフレキシブルな領域(N末端、C末端)にしか付加できません。
しかしPA tagはPro-Glyの間でβターン構造をとり、抗PA tag抗体はこのβターン構造を認識します。この性質によりPA tagを標的タンパク質内部のループ構造に挿入して使用することが可能です。
これまでにPA tagは下記のような実験に使用された実績があります。
- 「インテグリン」のループ構造にPA tagを挿入し、免疫沈降を実施。
- 機能部位や活性部位と隣接するため、末端へのタグ付加ができない「セマフォリン3A」のループ構造にPA tagを挿入し、活性をもったタンパク質の調製に成功。
アプリケーションデータ
培養上清からのタンパク質精製
細胞培養上清においてPA tagをN末端、C末端それぞれに融合させたタンパク質を抗PA tag抗体ビーズを用いて精製しました。
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PA tag N末融合タンパク質
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PA tag C末融合タンパク質
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サンプル HEK293T 培養上清 420 mL
(トランスフェクション後48 - 72時間)抗体 抗PA tag抗体ビーズ (Net 4 mL) 反応条件 2時間, 2 - 4 ℃ 洗浄条件 抗体ビーズの4倍量のTBS(20 mM Tris-HCl、150 mM NaCl)で5回洗浄 溶出条件 抗体ビーズと等量のPA tagペプチド(0.1 mg/mL)を10回添加
PA tagの挿入位置に関わらず、目的タンパク質を高純度かつ効率的に精製できました。
データ提供：
大阪大学 蛋白質研究所附属蛋白質解析先端研究センター 分子創製学研究室 高木淳一 先生、東北大学大学院医学系研究科 地域イノベーション分野 藤井 勇樹 先生
ウェスタンブロッティング
DYKDDDDK tagとPA tagをC末端側に融合させたIDH1を発現する骨肉種細胞のライセートをサンプルにウェスタンブロッティングを行いました。
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抗PA tag抗体は抗DYKDDDDK tag抗体よりも特異的にタグ融合タンパク質を認識していました。
データ提供: 東北大学大学院医学系研究科 地域イノベーション分野 加藤幸成 先生、金子美華 先生
膜タンパク質インテグリンの検出
膜タンパク質であるインテグリンのループ構造8か所にそれぞれPA tagを挿入し、抗PA tag抗体で免疫沈降をしました。
インテグリンのループ領域へのPAタグの挿入
(a) インテグリンαIIb(赤) β3(灰色)の細胞外領域の立体構造(PDB ID : 3FCS)。PAタグを挿入したループ領域をシアンで示す。
(b) 挿入部位付近のアミノ酸配列。12残基のPAタグは // の位置に挿入した。
(c) 各PAタグ挿入変異体の、抗インテグリン抗体(7E3、上段)および抗PAタグ抗体(NZ-1、下段)による免疫沈降の結果。
挿入したPA tagにより、ネイティブなインテグリンを沈降できました。
和光純薬時報 Vol.85 No.1(2017年1月号)
著者:大阪大学蛋白質研究所 高木淳一 先生、有森貴夫 先生、松永幸子 先生
ユーザーデータ
実際にお客様が実験で使用したデータをご紹介します。
| 「ウエスタンブロッティングによるPAタグ融合タンパク質の検出」 データご提供: 岐阜大学 医学系研究科・病態制御学講座・分子病態学分野 佐藤 克哉 様 |
Q&A
Q. 使用上の注意点は?
A. PA tagはヒトポドプラニンの配列を使用しているため、ポドプラニンを発現する細胞(HEK293、COS-1、COS-7)では内在性ポドプラニン(37kDa)が検出される場合があります。
| タンパク質精製 | 膜タンパク質であるため、標的タンパク質を細胞外に分泌させる場合は問題ございません。また細胞ライセート中において抗PA tag抗体は内在性ポドプラニンと反応しないことが報告されています。 |
| ウェスタンブロッティング | 37kDaに内在性ポドプラニンのバンドが検出される場合がございます。 |
| 免疫細胞化学染色 | ポドプラニンの発現が認められない細胞株をご利用ください。 |
Q. 抗PA tag抗体はヒト以外の動物のポドプラニンにも反応しますか。
A.抗PA tag抗体は霊長類のポドプラニンに反応します。マウス、ラット、ハムスター、イヌのポドプラニンとの交差性はございません。そのためCHO細胞でのタンパク質発現には問題なく使用できます。
Q. 実績細胞を教えてください。
A. HEK293、HEK293T、CHO、U-2 OS (Human osteosarcoma)、E. coli BL21 (DE3)、昆虫細胞(SF+, Sf9, Sf21, High Five)にて実績があります。なお当社で販売しているベクターは動物細胞でのタンパク質発現用に設計しているため、大腸菌や昆虫細胞をご使用の場合には、専用のベクターにタグ配列を組み込んでいただく必要があります。
Q.実績のあるアプリケーションを教えてください。
A.タンパク質精製、免疫細胞染色、表面プラズモン共鳴法、ウエスタンブロット、フローサイトメトリー、ELISAなどで使用された実績がございます。
Q.これまでに精製できたタンパク質を教えてください。
A.膜タンパク質、血清タンパク質、分泌タンパク質、膜タンパク質細胞外ドメイン、糖タンパク質、細胞内タンパク質、転写因子、キナーゼの精製実績がございます。サイズは15-500 kDaです。
Q. PA tag融合タンパク質が上手く競合溶出できません。
A. PA tagと抗PA tag抗体は結合が強く解離速度が非常に遅いため、競合溶出を行う場合はタグペプチド溶液を添加して5分以上インキュベートしてください。
Q. PA tag融合タンパク質を精製する際、夾雑物を有効に取り除く方法はありますか。
A. PA tagでは、高濃度のNaCl(0.15 - 1.0 M)を含むTBS溶液で前洗浄を行うことにより夾雑物を除去することが可能です。
製品一覧
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抗PA tag, ラットモノクローナル抗体 (NZ-1)
標識抗PA tag, ラットモノクローナル抗体 (NZ-1)
抗PA tag抗体ビーズ(アガロースビーズ)
抗PA tag抗体ビーズ(磁気ビーズ)
PA tag ペプチド (溶出用)
PA tag ペプチド (コントロール用)
PA tag 洗浄溶液
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