モノクローナル抗体アミノ酸配列解析「PEAKS AB」サービス
PEAKS ABサービスは、お客様よりご提供頂いたモノクローナル抗体サンプルから、正確なアミノ酸配列と、関連する翻訳後修飾（PTM）を提供するサービスで、サンプル調整・高分解能LC-MS/MS測定・データ解析・レポーティングまでをカバーしています。
データ解析には、カナダBSI社が開発した、モノクローナル抗体の配列を決定する独自のde novoシーケンシングテクニックを有する「PEAKS ABソフトウェア」を使います。
本サービスは、アイソタイプやアロタイプなど全種類のheavy & light chainの抗体配列に対応しています。
本サービスの特長
① 100% Sequence Coverage & Accuracy
各アミノ酸が20個以上のペプチドとマッピングされることを保証しています。
PEAKS ABソフトウェアを用いた右図のペプチドマッピング例では、peptide-spectrumレベルで、0.1%のFDRが得られています。
配列の下に表示されている色付けされたバーは、MS/MSデータから同定されたペプチドを示しており、色の種類はサンプル消化に使用される特定の酵素を表しています。
また、このサービスではde novoシーケンシング結果に基づいてアミノ酸レベルでクオリティコントロールを行っています。MS/MSデータから得られるダイレクトなフラグメントイオン情報は、アセンブルされたタンパク質配列中の各アミノ酸にリンクしています。
② Modification Analysis
翻訳後修飾（PTMs）及び配列変異体に関する定性・定量分析をご提供します。
下図は、PEAKS ABソフトウェアを用いた、PTM解析結果の図例です。
③ Leucine & Isoleucine Differentiation
酵素切断プレファレンス及びホモロジーデータベース統計に基づいて、ロイシンとイソロイシン残基を区別することができます。
サービスの流れ
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①サンプル調整
heavy & light chain separation
protein denaturation
multiple-enzyme digestion②LC-MS/MS測定
③PEAKS ABソフトウェアを用いたデータ解析
de novo antibody protein sequence
differentiate between Ile/Leu residues （オプション）
PTM and sequence variants（オプション）
レポーティング 
ご提供頂くもの
- モノクローナル抗体：0.2 mg以上
- 純度：95 %以上
納品物
試験報告書
PEAKS ABサービスでは、以下のような結果をお客様にお渡しします。
- Experimental Procedure
- Protein Sequence
- Homology Alignment
※右図はレポートサンプルです。
※実際のレポートはサービス内容に応じて変動します。
お見積り・ご注文について
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