RT-qPCR解析用 cDNA合成キット

ニッポンジーン GeneAce Turbo RT Kit with DNase I

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GeneAce Turbo RT Kit with DNase I は、改変型M-MLV (RNase H-) 逆転写酵素により、短時間で大量のcDNAを合成できます。本キットで合成したcDNAは、RT-qPCRにおいて高い定量を示し、RT-qPCR用の鋳型として適しています。さらに、付属のDNase I で、サンプル中のゲノムDNAを簡単に除去できます。

製品概要

“製品の外観”

【特長】

  • 約25分間でcDNA合成が完了 (DNase I処理時間を含む)
  • 微量RNAからも安定したcDNA合成が可能
  • 各種阻害物質に対する高い耐性
  • リアルタイムPCR試薬 (GeneAce qPCR Mix シリーズ) との組み合わせに最適

【用途】

  • RT-qPCR

製品内容

100回用 (20 µL反応系での使用回数です。)

構成品 容量 保存 備考
DNase I (RNase free) 20 µL x 1 -20°C
14 x DN Turbo Buffer 100 µL x 1 -20°C 14×DN Turbo Bufferには逆転写反応に必要な成分が含まれています。
5 x RT Turbo Buffer 400 µL x 1 -20°C 5 x RT Turbo Bufferの添加によりDNase I活性が停止します。
RT Turbo Primer Mix 100 µL x 1 -20°C RT Turbo Primer Mix は、Random Hexamer と Oligo (dT) Primer を最適な比率で配合したプレミックスです。
Turbo Enzyme Mix 100 µL x 1 -20°C Turbo Enzyme Mix は、改変型 M-MLV Reverse Transcriptase および RNase Inhibitor を含有しています。
ddWater (RNase free) 1.4 mL x 1 -20°C

使用例

1. RNAサンプルからgDNAを除去
RNAサンプル (1 µgまで) X µL
DNaseⅠ (RNase free) 0.2 µL
14× DN Turbo Buffer 1 µL
ddWater (Rnase free)
Total 14 µL
37℃、5 min → on ice
2.逆転写反応
1.の反応液 (RNA) X µL
5 x RT Turbo Buffer 4 µL
RT Turbo Primer Mix 1 µL
Turbo Enzyme Mix 1 µL
Total 20 µL
25℃、5 min (プライマーアニール)
50℃、10 min (逆転写反応)
85℃、5 min (酵素失活)
3.合成cDNAを活用
例)
  • リアルタイムPCRでの発現比較解析
  • デジタルPCRでの絶対定量
  • マイクロアレイ、RNA-Seqの前処理に

実験例1 cDNA合成量の比較

Jurkat Total RNA 10 ng または 0.1 ng を用いて各社キットでcDNAを合成した。 GeneAce SYBR™ qPCR Mix II を用いてリアルタイムqPCRを実施し、当社品を100% とする相対cDNA合成量をCt値から算出した。

cDNA合成量の比較 (鋳型RNA量10 ng)
cDNA合成量の比較 (鋳型RNA量0.1 ng)

【結果】
本製品は、鋳型RNA量 10 ng および 0.1 ng のいずれの条件でも、高いcDNA合成量を示した。

実験例2 阻害物質耐性

Mouse Total RNA (5 ng/µL) を鋳型に、各種阻害物質存在下で各社キットによるcDNA合成を行い、GeneAce SYBR™ qPCR Mix IIを用いてリアルタイムqPCRを実施した。本製品の阻害物質無添加条件を100%として、各条件の相対cDNA合成量をCt値から算出した。

阻害物質の耐性

【結果】
本製品は、複数の阻害物質存在下でも高いcDNA合成性能を維持した。特にSDS存在下では、他社品を大きく上回るcDNA合成量を示した。

実験例3 簡易抽出RNAからのcDNA合成

1. Jurkat細胞 (105, 104, 103 cells) から、Template Prepper for Cell RNA を用いてRNAを簡易抽出し、本製品でcDNAを合成した。
2. 得られたcDNAを鋳型として、GeneAce SYBR™ qPCR Mix II を用いてリアルタイムqPCRを実施した。

【結果】
簡易抽出RNAを用いた場合でも、本製品は定量性の高いcDNA合成を示した。

RT-qPCR の種類

当社 『siyaku blog』にて1 Step RT-qPCR と 2 Step RT-qPCR の違いに関する記事を読むことができます。

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関連製品一覧

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