エクソソーム単離~NGS解析パック
エクソソームの単離及びナノサイトの解析に加えて、NGS解析までをまとめたパックです。
ご提供いただいたサンプルからエクソソーム単離及びナノサイト解析を富士フイルム和光純薬にて実施します。ナノサイトで確認後、単離したエクソソームをNGS実施元に当社からお送りします。NGS実施元にてRNA抽出及びQC後、NGS解析を実施します。
既知のmiRNAに加え、新規のmiRNAまで解析対象という方などにおすすめのサービスです。
サービスの流れ
※生体試料サンプルについては弊社でもご準備が可能です(生体試料調達サービス)。
細胞の培養からについても実施できますので、ご相談ください。
エクソソームRNA抽出からmicroRNAの検出までの流れ
RNA抽出からデータ解析までの仕様
エクソソームRNA抽出
エクソソーム・セルフリーRNAに対応したRNA抽出キットにより精製。
ライブラリ調製
5′ P/3′ OHを末端にもつ成熟microRNAを対象にしたライブラリ調製を実施。トータルRNA 1 ngからライブラリ調製可能なキットにより微量RNAにも対応
シークエンシング
Illumina NovaSeq サンプルあたり標準1,000万ペア
エンドリード(2x150 bp換算でデータ量3 Gb)
データ解析
- リファレンス配列へのマッピング
- アノテーション済みmicroRNAのカウント
- 新規microRNAの探索
- サンプル間でのmicroRNA発現量比較
- 発現変動microRNAの標的予測とオントロジー解析
*解析内容は変更になる可能性がございます。ご依頼時にご確認ください。
価格・納期・納品物
価格例・納期
血清サンプル2検体でNGSパックを実施した場合
- エクソソーム単離~ナノサイト解析:250,000円/2検体
- small-RNA Seq:191,600円/2検体
合計概算価格:441,600円
納期:サンプル受領後2.5~3か月程度
Small RNA Seq 試験プラン
- Exosome small RNA extraction
- RNA sample QC for exosome small RNA,
ultra-low small RNA-seq library prep for exosome,
Illumina Novaseq 2x150bp configuration,
10M reads per sample - Standard BI for small RNA
- Data delivery via HDD
必要サンプル量(目安)
- 体液検体:0.5~1ml
- 培養上清:1~10 ml
※サンプルによってはsmall RNAの含有量が少ないエクソソームを放出するような例もあります。
あくまで目安になりますので、試験途中のQC試験などで都度、対応可否を判断させていただきます。
お見積り・ご注文について
- 掲載内容は本記事掲載時点の情報です。仕様変更などにより製品内容と実際のイメージが異なる場合があります。
- 掲載されている製品について
- 【試薬】
- 試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
- 試験研究用以外にご使用された場合、いかなる保証も致しかねます。試験研究用以外の用途や原料にご使用希望の場合、弊社営業部門にお問合せください。
- 【医薬品原料】
- 製造専用医薬品及び医薬品添加物などを医薬品等の製造原料として製造業者向けに販売しています。製造専用医薬品(製品名に製造専用の表示があるもの)のご購入には、確認書が必要です。
- 表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
- 表示している希望納入価格は本記事掲載時点の価格です。