バイオインフォマティクス: 次世代シークエンス解析サーバ・ソフトウェア

NGSデータ解析支援システム

アメリエフ株式会社

アメリエフ株式会社のNGSデータ解析支援システムは、PCに専用のソフトウェアをインストールして利用するデータ解析支援システムです。データ解析の効率化に貢献します。

Amelieff Quick Start Package

Amelieff Quick Start Packageは、PCに専用のソフトウェアをインストールして利用するデータ解析支援システムです。

Amelieff Quick Start Packageの特徴

  • 初学者の方は検証済みのプロトコルをGUI操作でそのまま実行することができます
  • 経験者の方はプロトコルをベースにしてご自身でカスタマイズすることができます

scRNAseq解析でのQCからクラスタリング、GOエンリッチメント解析

データ統合と二群間比較解析

解析プロトコル

解析プロトコル 概要 導入ツール システム要件
シングルセルRNAseq解析
  • 発現マトリクスデータから、Seurat を用いた細胞クラスタリング・細胞分類
  • monocleを用いた疑似系譜解析
Seurat, ggplot2, EnhancedVolcano, ReactomePA, clusterprofiler, monocle3, jupyter lab, R, python, Docker メモリ 64GB以上
RNA-seq解析
  • QCからリファレンスゲノムへのマッピング
  • 発現定量、主成分分析、階層的クラスタリング
  • 発現変動遺伝子の検出、二群間の発現比較結果の可視化
  • パスウェイエンリッチメント解析、GOエンリッチメント解析
FastQC, PRINSEQ, trimmomatic, STAR, featureCounts, gplots, edgeR, EnhancedVolcano, ReactomePA, clusterprofiler, jupyter lab, R, python, Docker メモリ 64GB以上

ラインナップ

商品名 ライセンス 詳細 税別価格
Amelieff Quick Start Package 最新 永続版 PC用ライセンス PC1台に解析プロトコル1本を導入致します。
  • ローカルマシンとしてご利用いただくライセンスです。(リモート接続非対応)
¥300,000
最新 永続版 サーバ用ライセンス サーバへセットアップ致します。
  • 複数人でリモート接続しご利用いただくライセンスです。
  • 弊社製サーバーへの導入は、特別価格でご提案致します。
お問い合わせ
解析システム エントリーモデル 解析プロトコル1本をノートPCへインストールしてご提供致します。
ノートPCのスペック
  • CPU: Core i7 4 core 8 thread
  • メモリ: 64 GB
  • SSD: 2TB
¥600,000~

※Docker For Windows、Docker for Macなどの利用にかかるライセンス(契約形態により有料)は本製品とは別でご購入いただく必要がございます。

製品サイト:https://amelieff.jp/server_system/quick-start-package/

お見積り・ご注文について

ご依頼方法

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  • 掲載されている製品について
    【試薬】
    試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
    試験研究用以外にご使用された場合、いかなる保証も致しかねます。試験研究用以外の用途や原料にご使用希望の場合、弊社営業部門にお問合せください。
    【医薬品原料】
    製造専用医薬品及び医薬品添加物などを医薬品等の製造原料として製造業者向けに販売しています。製造専用医薬品(製品名に製造専用の表示があるもの)のご購入には、確認書が必要です。
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