Universal Linker 『Maleimide-Type Linker Supports』
ホスホロアミダイト法を用いた固相合成では、合成する核酸の3'末端になるヌクレオシドを、リンカーを介して固相担体に担持させたヌクレオシドリンカーを使用します。合成する核酸の配列により3'末端は異なるため、この方法では、DNA（dA, dG, dC, dT）、RNA（rA, rG, rC, rU）の計8種類に加え、修飾核酸を導入する場合には、それに対応した種類の修飾ヌクレオシドを担持させた固相担体を準備する必要があり、煩雑です。そこで、この問題点を解決するために、従来一般的に使用されてきたヌクレオシドリンカーの代わりに、ユニバーサルリンカーを担持した固相担体が開発されています。
現在、最も広く利用されているユニバーサルリンカーは Ionis Pharmaceuticals 社が開発したUnyLinker™*で、これはマレイミド環を有するリンカーです。近年では、この他にも新しい骨格のユニバーサルリンカーや、固相担体からユニバーサルリンカーを切り出す条件も開発されています。
本品は、Ionis Pharmaceuticals が開発したユニバーサルリンカーを修飾した固相担体製品です。「マレイミド型リンカー」という製品名でご提供しております。複数の細孔径のラインアップをご用意しており、合成する核酸の種類に応じて最適な細孔径をお選びいただけます。
*UnyLinkerTMはIonis Pharmaceuticals, Inc. の商標です。
反応例
Maleimide-Type Linker PS を用いたオリゴヌクレオチド合成 (T10 および T20) の合成 （DMTr-Off モード）
1) T10mer の合成
| Solid Supports | UnyLinker™ | Crude Yield (%) |
Crude Purity (HPLC, area%) |
|||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Supplier | Materials | Pore Size (Å) | Substituent on N | Functional Loading (µmol/g) |
T9 <N-1> |
T10 <FLP> |
||
| 1 | FUJIFILM Wako | HCP (Low-Swelling Polymer) |
1000 | Ph | 49 | >90 | 5 | 92 |
| 2 | 2000 | 27 | >90 | 3 | 92 | |||
| 3 | 3000 | 29 | >90 | 4 | 90 | |||
| 4 | 4000 | 8 | >90 | 4 | 90 | |||
| C1 | Competitor A | CPG | 500 | Ph | 90 | 69 | 10 | 83 |
| C2 | 1000 | 48 | 71 | 7 | 87 | |||
| C3 | Competitor B | CPG | 1000 | Me | 45 | 67 | 2 | 93 |
| C4 | Competitor C | Swelling Polymer | Swelling Pore | Ph | 407 | 73 | 1 | 95 |
| C5 | Competitor D | 347 | 79 | 2 | 94 | |||
Note: These results were obtained from limited sample sizes and specific conditions
a) 当社PS 1000Å
b) 他社CPG 1000Å
Figure HPLC analysis of ONs released from T10-loaded (a) UnyLinker™ PS 1000Å (R=Ph) and (b) UnyLinker™ CPG 1000Å (R=Me) under Basic conditions. Basic condition: AMA at 60℃ for 1 h.
HPLC condition of Oligonucleotide
| Column size | : | Wakopak® Ultra C18-2 φ2.1 mm×100 mm (D) |
| Mobile phase | : | A) 100 mM TEAA aq., B) Acetonitrile |
| Gradient | : | 0-15 min B=5-15%, 15-20 min B=100%, 20-25 min B=5% |
| Flow rate | : | 0.3 mL/min |
| Temperature | : | 40℃ |
| Detection | : | UV260 nm |
| Injection vol. | : | 0.5 µL |
| Sample | : | DNA dT 10 mer, All PO |
2) T20mer
| Solid Supports | UnyLinker™ | Crude Yield (%) |
Crude Purity (HPLC, area%) |
|||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Supplier | Materials | Pore Size (Å) | Substituent on N | Functional Loading (µmol/g) |
T19 <N-1> |
T20 <FLP> |
||
| 1 | FUJIFILM Wako | HCP (Low-Swelling Polymer) |
1000 | Ph | 29 | >90 | 5 | 87 |
| 2 | 2000 | 19 | >90 | 4 | 83 | |||
| 3 | 3000 | 20 | >90 | 5 | 80 | |||
| 4 | 4000 | 8 | >90 | 5 | 84 | |||
| C1 | Competitor A | CPG | 500 | Ph | 90 | 73 | 12 | 80 |
| C2 | 1000 | 48 | 69 | 7 | 83 | |||
| C3 | Competitor B | CPG | 1000 | Me | 45 | 68 | 8 | 86 |
| C4 | Competitor C | Swelling Polymer | Swelling pore | Ph | 407 | 57 | 4 | 79 |
| C5 | Competitor D | 347 | 69 | 12 | 78 | |||
Note: These results were obtained from limited sample sizes and specific conditions
HPLC condition of Oligonucleotide
| Column size | : | Wakopak® Ultra C18-2 φ2.1 mm×100 mm (D) |
| Mobile phase | : | A) 100 mM HFIP + 8.6mM TEA aq., B) Acetonitrile |
| Gradient | : | 0-15 min B=1-9%, 15-20 min B=100%, 20-25 min B=1% |
| Flow rate | : | 0.3 mL/min |
| Temperature | : | 40℃ |
| Detection | : | UV260 nm |
| Injection vol. | : | 0.25 µL |
| Sample | : | DNA dT 20 mer, All PO |
製品一覧
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核酸合成用
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