新型コロナウイルス変異検出キット (RT-qPCR)
本キットは、当社独自の設計手法により開発した検出試薬で、新型コロナウイルス (SARS-CoV-2) の変異をワンステップ RT-qPCR法で検出することができます。
概要
世界中で新型コロナウイルスの変異株が拡大しており、日本国内でも感染者が多数報告されています。変異株は世界各国で確認されており、感染経路の特定と早急な封じ込めが必要とされています。
当社では、WHOが懸念する変異株(Variants of Concern; VOC) に分類されたオミクロン株(B.1.1.529)が保有するN del31-33変異を検出できるキットを販売しています。
N del31-33：N領域の31~33番目の3アミノ酸 グルタミン酸(E)、アルギニン(R)、セリン(S)が欠損した変異。
これまでの変異株より高い感染力を持つオミクロン株(B.1.1.529)特有の変異。
| 変異株 （Lineage No.） |
最初に検出された国 | N501Y変異 | E484K変異 | L452R変異 | E484Q変異 | del247-253変異 | N del31-33変異 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 従来株 | 中国（武漢） | － | － | － | － | － | － |
| アルファ株 （B.1.1.7） |
イギリス | ＋ | － | － | － | － | － |
| ベータ株 （B.1.351） |
南アフリカ | ＋ | ＋ | － | － | － | － |
| ガンマ株 （P.1） |
ブラジル | ＋ | ＋ | － | － | － | － |
| イプシロン株 （B.1.427/B.1.429） |
アメリカ | － | － | ＋ | － | － | － |
| カッパ株 （B.1.617.1） |
インド | － | － | ＋ | ＋ | － | － |
| デルタ株 （B.1.617.2） |
インド | － | － | ＋ | － | － | － |
| ラムダ株 （C.37） |
ペルー | － | － | － | － | ＋ | － |
| オミクロン株 （B.1.1.529） |
南アフリカ | ＋ | －※ | － | －※ | － | ＋ |
- E484Aの変異あり。
特長
判定が容易
変異型と野生型のプライマー/プローブセット使用時のCt値の比較で判定するため、判定が容易！
＜判定例＞
- 測定サンプル：ベータ株（B.1.351） (TY8-612, N501Y変異/ E484K変異, 国立感染症研究所より分与)
- 測定キット：SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit（製品コード：287-35701）※本品は販売終了しました。
- サンプルコピー数：5,000コピー/Well
- サイクル数：45
従来（非変異）型及び変異型の増幅曲線がいずれも立ち上がった場合は、Ct値を比較して変異の有無を判定する。
上の結果の場合、従来 (非変異) 型検出用の「501N Wild type Primer / Probe（青）」について、わずかに増幅シグナルが見られたが、変異型検出用の「N501Y Mutant type Primer/Probe（赤）」の方がより低いCt値で検出されたため、N501Y変異株と判断ができる。
ワンステップRT-qPCR法で迅速に変異を検出
約70分でPCR反応が完了！
独自開発のプライマー・プローブで、高感度に変異を検出
各変異の測定データは、製品ページをご覧ください。
操作方法
キットコンポーネント
| 構成品 | 容量 | Probe標識 |
|---|---|---|
| RT Enzyme Mix(20×) | 20 µL×1 | ― |
| One-Step Reaction Mix (2×) | 200 µL×1 | ― |
| Wild type Primer & Probe Mixture | 10 µL×1 | FAM |
| N del31-33 Mutant Type Primer & Probe Mixture | 10 µL×1 | FAM |
※本キットの陽性コントロールが必要な場合は弊社までお問合せください。
別途必要な装置・器具・試薬
- qPCR(Real-Time PCR) 装置
- RNA精製キット (例 : コードNo. 310-08931，ISOSPIN Viral RNA，ニッポンジーン )
- マイクロチューブ遠心機
- ボルテックスミキサー
- Nuclease フリー滅菌水 (例 : コード No. 316-90101, ニッポンジーン )
- マイクロピペットおよび Nuclease フリーピペットチップ
- Nuclease フリー1.5mL チューブ (DNA/RNA 低吸着品が望ましい。例：Micro tube 1.5ml DNA LowBind, Sarstedt)
- qPCR(Real-Time PCR) プレートとプレートシール、もしくは qPCR(Real-Time PCR) チューブとキャップ
- 氷もしくは保冷剤
製品一覧
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※容量について：①従来株のプライマー/プローブが入ったウェル、②変異株のプライマー/プローブが入ったウェルの2ウェルで測定するため、1検体でPCR2反応が必要です。
- 掲載内容は本記事掲載時点の情報です。仕様変更などにより製品内容と実際のイメージが異なる場合があります。
- 掲載されている製品について
- 【試薬】
- 試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
- 試験研究用以外にご使用された場合、いかなる保証も致しかねます。試験研究用以外の用途や原料にご使用希望の場合、弊社営業部門にお問合せください。
- 【医薬品原料】
- 製造専用医薬品及び医薬品添加物などを医薬品等の製造原料として製造業者向けに販売しています。製造専用医薬品(製品名に製造専用の表示があるもの)のご購入には、確認書が必要です。
- 表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
- 表示している希望納入価格は本記事掲載時点の価格です。
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