シークエンス: 次世代シーケンス

次世代シークエンサーによるバイオDX 解析サービス

プラチナバイオ株式会社

バイオインフォマティクス分野のトップランナーで科学技術顧問である坊農秀雅の技術監修の下、コンサルティングを行いながらお客様の目的を丁寧に汲み取り、次世代シークエンサーを用いてゲノム解析を高精度に行います。

ロングリード解析 サービス PacBio® Sequel IIe System

99.999% 以上の優れたコンセンサス精度を実現しながら、数十kb のリード長により完全なゲノムアセンブルや全長転写産物の配列決定を容易にします。

トミーデジタルバイオロジーHP を基に作成

〇 使用機種:PacBio Sequel IIe

〇 サービス事例:

  • De novo ゲノムシークエンス
  • Iso-Seq(完全長cDNA /アイソフォームプロファイリング)
※その他アプリケーションについては要相談

〇 オプション:

  • DNA/RNA 抽出
  • アセンブル、遺伝子機能アノテーション
  • 事業化コンサルティング

〇 納期:1 〜2 ヶ月

〇 価格:70 万円/ セル〜

〇 注意事項:

  • 納期および価格はサンプルの品質や数量により異なりますの で予めご了承ください。
  • サンプル品質に依存するため、データ保証はいたしかねます。

非モデル生物のRNA-Seq解析

ゲノム情報が未知の非モデル生物を対象に、目的の機能性遺伝子群を新規に特定し、新たな付加価値づくりに貢献します。

De novo Assembly でリードを
繋ぎ合わせてコンティグを作成

〇 使用機種:Illumina NovaSeq 6000
  解析ツール:Trinity

〇 解析内容:発現遺伝子カタログ作成

〇 オプション:発現機能解析、コンサルティング等

〇 納期:1 〜2 ヶ月

〇 価格:15 万円/ 検体〜

ロングリードメタゲノム解析サービス(16S rRNAアンプリコン解析)

ロングリードシークエンサーを用いて16S rRNA 遺伝子の全長配列を読み取り、科学技術顧問の坊農秀雅のSAQE を用いてデータ解析を行うことで、種レベルでの分類・可視化を実現

〇 使用機種:Pacbio Sequel Iie / Oxford Nanopore MinION

〇 解析内容:系統(属・種)とその存在割合を可視化

〇 オプション:DNA 抽出、その他アプリケーション

〇 納期および価格:内容に応じて要相談
(例)24 サンプル、MinION 使用、DNA 抽出依頼なしの場合
  納期:約1 週間、価格:8 万円/ サンプル

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