R&D Systems 糖鎖標識/糖鎖検出

グリコシル化は多数のタンパク質や脂質で起こる豊富な翻訳語修飾です。 グリコシル化は、タンパク質の折り畳み、分泌、局在化、安定性および活性調節に重要であることが知られています。タンパク質のグリコシル化を簡単に分析できるように、SDS-PAGEと蛍光イメージャーを使用してグリカンを標識・検出できるキットや標識酵素、蛍光標識ドナー基質を提供しています。

グリカン標識・検出キット
グリカン標識・検出キット
グリカン標識試 薬標識グリカン
グリカン標識試薬
標識グリカン
フコシル化によるグリカン標識試薬
フコシル化による
グリカン標識試薬
シアル化によるグリカン標識試薬
シアル化による
グリカン標識試薬
ヘパラン硫酸/ヒアルロン酸標識試薬
ヘパラン硫酸/
ヒアルロン酸標識試薬
O-GlcNAc/O-GalNAc標識試薬
O-GlcNAc/
O-GalNAc標識試薬

N-グリカン標識・検出

N-グリカン検出原理

(A) N-グリカン特異的標識は、Cy3結合 Neu5Acなどの蛍光標識シアル酸の直接取り込み、または (B) Cy3-Neu5Ac による天然のシアル酸の置換により行われます。どちらの方法でも、Cy3-Neu5Ac はN-グリカン特異的シアリルトランスフェラーゼであるST6Gal1 を介して行われますが、代替法として蛍光標識 Neu5Ac ドナー基質とシアリルトランスフェラーゼを標識に使用することもできるかもしれません。最大限の標識を得るために、初めにサンプルを組み換えC. perfringens ノイラミニダーゼ(Neu) を使用して (B) のように脱シアリル化させます。ノイラミニダーゼは α2-3および α2-6結合シアル酸を特異的に除去します。次にST6Gal1 および Cy3-Neu5Acで標識した後、標識された生成物をSDS-PAGEで分離し、蛍光イメージャーを使用して検出します。

品名 コード 仕様
N-glycan Labeling and Detection Kit EA007 N-グリカン標識・検出
PNGase F N-glycan Releasing Kit EA006 糖タンパク質中のN-グリカン切断
標識酵素/シアル酸除去酵素 コード 機能
ST6Gal1 7620-GT N-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST3Gal4 10496-GT N-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST3Gal6 10591-GT N-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
C. perfringensNeuraminidase Protein 5080-NM α2-3 および α2-6 結合シアル酸特異的除去
M. viridifaciensNeuraminidase Protein 5084-NM
蛍光標識シアル酸供与体 コード 機能
CMP-Cy3-Sialic Acid ES402 遊離糖鎖のCy3蛍光標識
CMP-Cy5-Sialic Acid ES302 遊離糖鎖のCy5蛍光標識
CMP-C9-Biotin-Sialic Acid ES201 タンパク質および脂質のシアログリカンの直接的なビオチン標識

O-グリカン標識・検出

O-グリカン検出原理

(A) O-グリカン特異的標識は、Cy5標識Neu5Acなどの蛍光標識シアル酸の直接的な取り込み、または(B)天然シアル酸の蛍光標識シアル酸(例:Ct5-Neu5Ac)への置換により行われます。初めにサンプルを組み換え C. perfringens ノイラミニダーゼ(Neu) を使用して脱シアリル化させます。その後、Cy5-Neu5AcをST3Gal1、ST3Gal2 またはS6GalNAc2などのO-グリカン特異的シアリルトランスフェラーゼにより導入します。標識された生成物をSDS-PAGEで分離し、蛍光イメージャーを使用して検出します。

標識酵素/シアル酸除去酵素 コード 機能
ST3Gal1 6905-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST3Gal2 7275-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST6GalNAc1 9154-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST6GalNAc2 6468-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST6GalNAc4 6876-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
C. perfringensNeuraminidase Protein 5080-NM α2-3 および α2-6 結合シアル酸特異的除去
M. viridifaciensNeuraminidase Protein 5084-NM
蛍光標識シアル酸供与体 コード 機能
CMP-Cy3-Sialic Acid ES402 遊離糖鎖のCy3蛍光標識
CMP-Cy5-Sialic Acid ES302 遊離糖鎖のCy5蛍光標識
CMP-C9-Biotin-Sialic Acid ES201 タンパク質および脂質のシアログリカンの直接的なビオチン標識
データ例 A
データ例 B

(A) Recombinant Human ACE-2 (#933-ZN) は、Recombinant Human ST6Gal1 (#7620-GT) およびCy3-Neu5Acを使用してN-グリカン(N) を標識、Recombinant Human ST3Gal2 (#7275-GT)およびCy3-Neu5Acを使用してO-グリカン(O)を標識した。次に標識したサンプルをPNGase G N-glycan Releasing Kit (#EA006) を使用して、PNGase F 100ng から段階希釈したもので処理した。SDS-PAGE により分離し、蛍光イメージャーで画像を得た。
標識されたN-グリカンはPNGase F により切断されましたが、O-グリカンでは切断が見られませんでした。これはそれぞれST6Gal1 および ST3Gal2 によるN-およびO- グリカンの特異的標識を示しています。

(B) Recombinant Human CA125/MUC16 (#5609-MU) は、Recombinant Human ST6Gal1 (#7620-GT) およびCy5-Neu5Acを使用してN-グリカン(N) を標識、Recombinant Human ST3Gal2 (#7275-GT)およびCy5-Neu5Acを使用してO-グリカン(O)を標識した。次に標識したサンプルをPNGase G N-glycan Releasing Kit (#EA006) を使用して、PNGase F 640ng から段階希釈したもので処理した。SDS-PAGE により分離し、蛍光イメージャーで画像を得た。
標識されたN-グリカンはPNGase F により切断されましたが、O-グリカンでは切断が見られませんでした。これはそれぞれST6Gal1 および ST3Gal2 によるN-およびO-グリカンの特異的標識を示しています。

データ例 C

(C) Recombinant Human CA125/MUC16 (#5609-MU) は、Recombinant Human ST6Gal1 (#7620-GT) およびCy5-Neu5Acを使用してN-グリカン(N) を標識、Recombinant Human ST3Gal2 (#7275-GT)およびCy5-Neu5Acを使用してO-グリカン(O)を標識した。次に標識したサンプルをPNGase G N-glycan Releasing Kit (#EA006) を使用して、PNGase F 640ng から段階希釈したもので処理した。SDS-PAGE により分離し、蛍光イメージャーで画像を得た。標識されたN-グリカンはPNGase F により切断されましたが、O-グリカンでは切断が見られませんでした。これはそれぞれST6Gal1 および ST3Gal2 によるN-およびO-グリカンの特異的標識を示しています。

グリカン標識/標識グリカン

グリカン生成図
生成物SDS-PAGE画像

(A) Cy5-Fucose Labeled N2f (コード: GL304)の生成図。 Recombinant Human Fucosyltransferase/FUT8 (コード: 5768-GT) および GDP-Cy5-Fucose (コード: ES301) を使用した方法。Recombinant Human B4GalT1 (コード: 3609-GT), Recombinant Human B3GNT2 (コード: 3960-GT)のような様々なグリコシルトランスフェラーゼを用いたCy5-Fucose Labeled Glycan G2f (コード: GL302), Cy5-Fucose Labeled xG2f, Cy5-Fucose Labeled xxG2f の多段階合成。または F. keratolyticus Endo-beta-Galactosidase (コード: 8620-GH) によるxxG2fの加水分解。Cy5-Fucose Labeled M2f はRecombinant Human Hexosaminidase/HEXA (コード: 6237-GH)により生成されます。

(B) 図Aに示したグリカン標識反応とEndo-beta-Gal アッセイの生成物をSDS-PAGEで分離し、FluorChemイメージャーで可視化した図。

グリカン標識/修飾酵素 コード 機能
B4GalT1 3609-GT β4-Gal の導入およびⅡ型ラクトサミンの生成
B3GalT5 10555-GT β3-Gal の導入およびⅠ型ラクトサミンの生成
B3GNT2 3960-GT β3-Gal の導入およびⅡ型ラクトサミンの生成
Endo-beta-Galactosidase 8620-GH ポリ-N-アセチルラクトサミンおよび硫酸化構造の内部β(1-4) ガラクトース結合の加水分化
Endo-S2 10976-GH IgG Fc領域のグリカン除去
Fucosyltransferase 8/FUT8 5768-GT コア-フコースの標識
Hexosaminidase A/HEXA 6237-GH 非還元GlcNAcの除去
N-Acetylglucosaminyltransferase1/MGAT1 8334-GT GlcNAcのalpha 3 armへの導入
N-Acetylglucosaminyltransferase3/MGAT3 7359-GT 二分割化(bisecting)GlcNAcの導入
N-Acetylglucosaminyltransferase V/MGAT5 5469-GT GlcNAcのalpha 6 armへの導入
ST6Gal1 7620-GT α2-6 結合シアル酸の導入
ST3Gal6 10591-GT α2-3 結合シアル酸の導入
蛍光標識ドナー単糖類 コード 機能
GDP-Cy3-Fucose ES401 遊離糖鎖のCy3蛍光標識
GDP-Cy5-Fucose ES301 遊離糖鎖のCy5蛍光標識
GDP-Biotin-Fucose ES202 遊離グリカン、糖タンパク質、糖脂質の直接的なビオチン標識
CMP-Cy3-Sialic Acid ES402 遊離糖鎖のCy3蛍光標識
CMP-Cy5-Sialic Acid ES302 遊離糖鎖のCy5蛍光標識
CMP-C9-Biotin-Sialic Acid ES201 タンパク質および脂質のシアログリカンの直接的なビオチン標識
蛍光標識グリカン コード 機能
Cy5-Fuc-Labeled M1N1f GL301 レクチンの基質として使用でき、さまざまなグリコシダーゼやグリコシルトランスフェラーゼの研究に使用できます。また、シアリルルイスX構造などのさまざまなグリカンエピトープを合成するための足場としても使用できます。
Cy5-Fuc-Labeled Glycan G2f GL302
Cy5-Fuc-Labeled N2f GL304

フコシル化によるグリカン標識

グリカン生フコシル化による標識図
フコシル化によるグリカン標識は、蛍光標識フコースを遊離グリカンに直接組み込むか、天然に存在するフコース糖鎖を蛍光標識フコースに置換することで行われます。
フコース標識酵素/フコース糖鎖除去酵素 コード 機能
Fucosyltransferase 2/FUT2 7770-GT α1-2フコシルトランスフェラーゼ
Fucosyltransferase 3/FUT3 4950-GT α1-3 および α1-4 フコシルトランスフェラーゼ
Fucosyltransferase 5/FUT5 4949-GT α1-3フコシルトランスフェラーゼ
Fucosyltransferase 7/FUT7 6409-GT α1-3フコシルトランスフェラーゼ
Fucosyltransferase 8/FUT8 5768-GT α1-6フコシルトランスフェラーゼ
Fucosyltransferase 9/FUT9 9347-GT α1-3フコシルトランスフェラーゼ
Fucosyltransferase 11/FUT11 5964-GT α1-3フコシルトランスフェラーゼ
Protein O-Fucosyltransferase 1/POFUT1 7409-GT Protein O-フコシルトランスフェラーゼ
Tissue alpha-L-Fucosidase/FUCA1 7039-GH 糖脂質およびオリゴ糖のα-Lフコース残基の加水分解
蛍光標識フコース供与体 コード 機能
GDP-Cy3-Fucose ES401 遊離糖鎖のCy3蛍光標識
GDP-Cy5-Fucose ES301 遊離糖鎖のCy5蛍光標識
GDP-Biotin-Fucose ES202 遊離グリカン、糖タンパク質、糖脂質の直接的なビオチン標識
GDP-N3-Fucose ES101 フコシル化振り感のアジド標識

シアリル化によるグリカン標識

シアリル化によるO-グリカン標識
シアリル化によるN-グリカン標識

(A) O-グリカン特異的標識は天然シアル酸を蛍光標識シアル酸(例:Cy5-Neu5Ac)に置換することにより行われます。初めにサンプルを組み換え C. perfringens ノイラミニダーゼ(Neu) を使用して脱シアリル化させます。その後、Cy5-Neu5AcをST3Gal1、ST3Gal2 またはS6GalNAc2などのO-グリカン特異的シアリルトランスフェラーゼにより導入します。

(B) N-グリカン特異的標識は、Cy3結合 Neu5Acなどの蛍光標識シアル酸の直接取り込み、または (B) Cy3-Neu5Ac による天然のシアル酸の置換により行われます。初めにサンプルを組み換えC. perfringens ノイラミニダーゼ(Neu) を使用して脱シアリル化させます。本酵素は α2-3およびα 2-6結合シアル酸を特異的に除去します。次に、N-グリカン特異的シアリルトランスフェラーゼを使用して、蛍光標識シアル酸を取り込みます。

シアル酸標識酵素尾/シアル酸糖鎖除去酵素 コード 機能
ST6Gal1 7620-GT N-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST3Gal4 10496-GT N-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST3Gal6 10591-GT N-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST3Gal1 6905-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST3Gal2 7275-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST6GalNAc1 9154-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST6GalNAc2 6468-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST6GalNAc4 6876-GT O-グリカン特異的 シアル酸転移酵素
ST8Sia1 6716-GT ポリシアル酸特異的 シアル酸転移酵素
ST8Sia2 6590-GT ポリシアル酸特異的 シアル酸転移酵素
ST8Sia4 7027-GT ポリシアル酸特異的 シアル酸転移酵素
STSia6 9587-GT ポリシアル酸特異的 シアル酸転移酵素
C. perfringensNeuraminidase Protein 5080-NM α2-3 および α2-6 結合シアル酸特異的除去
M. viridifaciensNeuraminidase Protein 5084-NM
蛍光標識シアル酸供与体 コード 機能
CMP-Cy3-Sialic Acid ES402 遊離糖鎖のCy3蛍光標識
CMP-Cy5-Sialic Acid ES302 遊離糖鎖のCy5蛍光標識
CMP-C9-Biotin-Sialic Acid ES201 タンパク質および脂質のシアログリカンの直接的なビオチン標識
CMP-N3-Sialic Acid ES102 タンパク質および脂質上の末端シアログリカンのアジド標識

ヘパラン硫酸/ヒアルロン酸標識

ヘパラン硫酸/ヒアルロン酸標識
ヒアルロン酸またはヘパラン硫酸の標識は、多糖類をそれぞれヒアルロン酸またはヘパラン硫酸の標識酵素であるヒアルロン酸合成酵素(HAS)またはEXT1/2で処理し、UDP-Azido-GlcNAcとUDP-GlcAを加えることで行われます。その後、クリックケミストリー反応を行い、アジド基を蛍光へ置換します。
ヘパラン硫酸またはヒアルロン酸標識酵素/
ヘパラン硫酸またはヒアルロン酸グリコサミノグリカン除去酵素
コード 機能
EXT1/2 8567-GT ヘパラン硫酸標識酵素
Hyaluronan Synthase (HAS) 9585-GT ヒアルロン酸標識酵素
Heparanse/HPSE 7570-GH ヘパラン硫酸消化酵素
9788-GH
Heparinase I 7897-GH
Heparinase I 5830-GH
Heparinase II 6336-GH
Heparinase III 6145-GH
Hyaluronan Lyase 5150-GH ヒアルロン酸消化酵素
Hyaluronidase 1/HYAL1 7358-GH
Hyaluronidase 2/HYAL2 11012-GH
Hyaluronidase 4/HYAL4 6904-GH
蛍光標識GlcNAc供与体 コード 機能
UDP-Azido-GlcNAc ES104 ヘパラン硫酸プロテオグリカンまたはヒアルロン酸上のGlcNAcのアジド標識
標識プロテオグリカン コード 機能
HPSE Substrate ES020 非還元末端ビオチン化HSプロテオグリカン
Cy5 Labeled Heparan Sulfate Proteoglycan (Cy5-HSPG) GL402 さまざまなヘパラナーゼおよびヘパリナーゼの活性研究のための基質として使用される
Cy5 Labeled Hyaluronan (Low MW) GL401 さまざまなヒアルロン酸特異的加水分解酵素およびリアーゼの基質として使用される

O-GlcNAc標識

“O-GlcNAc/O-GalNAc標識
O-GlcNAcは、(A) UDP-Azido-GalNAcを含むB3GALNT2またはB4GalT1(Y285L)を使用して直接標識した後、クリックケミストリー反応を行ってアジド基を蛍光に置換するか、(B) 蛍光標識シアル酸供与体とB4GalT1およびST6Gal1を使用したタンデム標識によって標識ができます。
O-GlcNAcタンデム標識酵素 コード 機能
B4GalT1 3609-GT O-GlcNAc タンデム標識
ST6Gal1 7620-GT
タンデム標識のための蛍光標識糖類ドナー コード 機能
UDP-Azido-GlcNAc ES104 O-GlcNAc タンデム標識
CMP-Cy3-Sialic Acid ES402
CMP-Cy5-Sialic Acid ES302
O-GlcNAc 直接標識酵素 コード 機能
B4GalT1 (Y285L) 7040-GT O-GlcNAc 直接標識
直接標識のための蛍光標識糖類ドナー コード 機能
UDP-Azido-GalNAc ES103 O-GlcNAc 直接標識
O-GlcNAc導入/除去酵素 コード 機能
O-GlcNAc Transferase/OGT 8446-GT O-GlcNAc導入酵素
O-GlcNAcase/OGA 6779-GH O-GlcNAc除去酵素

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