ゲノム解析サーバ

• 経験豊かな臨床医 兼 Bioinformaticianが、臨床の観点から解釈を添えた解析を行える数少ないゲノム解析会社です。
• 独自のフルオーダーメイド可能な解析ソフトウェアを自社開発し、進化の早いゲノム医療で、世界の最先端の技術やデータを取り込み、臨床医自らが臨床的視点をソフトウェア化しており、他にはない解析、解析環境を提供しています。
• がん研究で国内で最先端の研究機関の研究サポートを行ってきた経験を生かして、研究サポート・コンサルティング等、臨床・研究のサポート・サービスを提供します。
• 大学病院・癌の研究機関と密接に連携しており、これらの特徴の生かしたサービスを提供します。

cBioinformatics社の事業は、代表取締役の山口医師が、先行的に事業化を行なっていたものをベースとしております。
がん診断の実際にも精通し、統合ゲノム解析についても実績と技術を有し、医学的・臨床的な意義を加えた解釈、解析、解析後の考察まで受託できるのが特徴です。
国内トップ研究機関からも臨床的解析をリピート依頼されております。

こちらは、ミニエンド解析サーバとなります。

ミニエンドサーバ RNA-seqを手軽に手元で行えるマシーン ​～10サンプルであれば数時間程度で解析が完了 ソフトウェア 【RNA-seqの解析対象】 クオリティチェック トリミング マッピング カウント取得 ​ その他オプションあり 【スペック】 CPU: Intel i7 (第9世代) memory: 64GB 12 core storage: SSD 512G 【価格】 標準販売価格：95万円（税抜き）

こちらは、ミドルエンド解析サーバとなります。

ミドルエンドサーバ 大量の検体のRNA-seqを並列作業で行える中性能マシーン ​ DNA-seqにおいて、オリジナルのコントロールサンプルを作るなど、カスタマイズすることも可能 ～100サンプルであれば1日程度で解析が完了 ソフトウェア 【RNA-seqの解析対象】 クオリティチェック トリミング マッピング カウント取得 変動遺伝子検定 ​ その他オプションあり 【DNA-seqの解析対象】 クオリティチェック トリミング マッピング 変異コール アノテーション ​ その他オプションあり 【スペック】 CPU: Intel i7 (第9世代) memory: 128GB 32 core storage: SSD 512G + HDD 20TB Intel i9等にアップグレード可能 【価格】 標準販売価格：460万円（税抜き）

こちらは、ハイエンド解析サーバとなります。

ハイエンドサーバ 大量の検体のRNA-seqをスピーディに行う必要のある研究者向けハイスペックマシーン 規模の大きい研究室、多数の検体を多面的に解析する必要がある研究者に最適なサーバ ソフトウェア 【RNA-seqの解析対象】 クオリティチェック トリミング マッピング カウント取得 変動遺伝子検定 ​ その他オプションあり 【DNA-seqの解析対象】 クオリティチェック トリミング マッピング 変異コール アノテーション ​ その他オプションあり 【スペック】 CPU: Intel i7 (第9世代) memory: 256GB 64 core storage: SSD 512G + HDD 20TB Intel i9等にアップグレード可能 【価格】 標準販売価格：660万円（税抜き）

RNAseqやDNAseq解析パイプラインのようなベーシックなものだけでなく、cBioinformaticsでは研究者の方のご要望、ニーズに合わせてカスタムなパイプラインの構築、それを実装した解析サーバの販売にも対応しております。
下記に示したのは、「DNAseq, RNAseqデータからがん抗原として認識されるアミノ酸配列を予測するパイプラインを構築したい」というお客様に提供させて頂いたパイプラインの例になります。
腫瘍細胞では1塩基置換、Fusion, Frameshiftといった変異を要因として免疫細胞にがん抗原として認識されるタンパク質が発現している場合があります。
このネオアンチゲンを高精度に予測できるパイプライン構築を行いました。

• DNAseq, RNAseqを統合したマルチオミクス解析パイプラインを構築
• 複数の epitope 予測アルゴリズムを用いることで幅広く候補を探索
• 単純なNeo-Antigenの予測ではなく、発現情報、Phasing状態（変異または多型が相同染色体のどちらのコピー由来か）を加味し、WTと比較した場合のMHC I との親和性を計算することで高精度な推定及び有望な候補のみのフィルタリングが可能となっております

このようなカスタムパイプラインをご希望の方は、是非一度お問い合わせください。 研究目的に最適なものをご提供できるよう、ご相談を承っております。