バイオインフォマティクス: 公共データベース解析

公共データベース解析

cBioinformatics株式会社

臨床医による臨床・研究のための次世代型ゲノム解析サービス

  • 医療と工学のクロスフィールドであるゲノム解析は、本来、双方の専門的な視点で深く探求することで、新しい世界を切り開けられる領域です。
  • cBioinformatics社のゲノム解析は、クリニカルの豊富な経験を元に、最新のソフトウェア資産を活用し、バイオインフォマティクスの工学的な面に支配されず、クリニカルに繋がる「考える解析」を行います。
  • 溢れる好奇心を持って研究されるクリニカルの研究者を研究の主役にするための次世代解析サービスを提供します。
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cBioinformatics社の強み

  • 経験豊かな臨床医 兼 Bioinformaticianが、臨床の観点から解釈を添えた解析を行える数少ないゲノム解析会社です。
  • 独自のフルオーダーメイド可能な解析ソフトウェアを自社開発し、進化の早いゲノム医療で、世界の最先端の技術やデータを取り込み、臨床医自らが臨床的視点をソフトウェア化しており、他にはない解析、解析環境を提供しています。
  • がん研究で国内で最先端の研究機関の研究サポートを行ってきた経験を生かして、研究サポート・コンサルティング等、臨床・研究のサポート・サービスを提供します。
  • 大学病院・癌の研究機関と密接に連携しており、これらの特徴の生かしたサービスを提供します。

臨床学的解析サービスの実績

cBioinformatics社の事業は、代表取締役の山口医師が、先行的に事業化を行なっていたものをベースとしております。
がん診断の実際にも精通し、統合ゲノム解析についても実績と技術を有し、医学的・臨床的な意義を加えた解釈、解析、解析後の考察まで受託できるのが特徴です。
国内トップ研究機関からも臨床的解析をリピート依頼されております。

  • Omicsデータ統合解析

    変異データ統合解析

    フルゲノムデータ変異解析

  • RNA seq一次解析

    GO解析・Pathway解析

    Single Cell 解析

  • ChIP seq一次解析

    発現データ解析

    解析パイプライン

公共データベース解析の概要

  • オンライン上には多くのデータ(ビッグデータ)が存在します
  • アイディアがあれば、これらのデータを用いて研究が可能です
  • In silico screeningと呼ばれるこの手法は、網羅的なデータ量が増え続ける現代では、大きな研究躍進の武器になります
  • cBioinformatics社の解析者は研究者として、この手法を用いて様々な研究を実施しており、得意とする分野です

公共データベースの利用

  • 利点
    ✔ データが無料で入手可能
    ✔ 多くのデータが閲覧可能
    ✔ 使い道は自由で様々
     ・バリデーションとして利用
     ・自分で実施した実験のデータとの混合解析
     ・メタ解析

  • 有用なデータが非常に多く眠っているため、
    利用したい企業や研究者は多い

  • 欠点
    ✔ 様々なデータの形式があるため、とにかく見にくい
    ✔ どこに何のデータがあるのか慣れが必要
    ✔ どの段階のデータ(臨床のフェーズⅠ~Ⅲ、非臨床、
    スクリーニング等)なのか、解析全体を適切に理解・
    解釈・分析が必要
    ✔ 目的に沿ったデータがないこともある

  • cBioinformatics社が得意としている分野であり、依頼することで解決できる

利点
✔ データが無料で入手可能
✔ 多くのデータが閲覧可能
✔ 使い道は自由で様々
 ・バリデーションとして利用
 ・自分で実施した実験のデータとの混合解析
 ・メタ解析

有用なデータが非常に多く眠っているため、
利用したい企業や研究者は多い

欠点
✔ 様々なデータの形式があるため、とにかく見にくい
✔ どこに何のデータがあるのか慣れが必要
✔ どの段階のデータ(臨床のフェーズⅠ~Ⅲ、非臨床、スクリーニング等)なのか、解析全体を適切に理解・解釈・分析が必要
✔ 目的に沿ったデータがないこともある

cBioinformatics社が得意としている分野であり、依頼することで解決できる

バーチャルスクリーニングを活用した新たな開発手法

一つのパイプラインに多額の費用と時間をかけても外れることが多い中、ビックデータを活用した新しい開発手法により、短期間・低コストで高い成功確率で開発できるプラットフォーム・サービスを提供します。

バーチャルスクリーニングの例

バーチャルスクリーングによって他部位への適用を確認すると、前立腺がんでの適用が確認され、それを実際の検体でバリデーションすると、正しいことが検証可能であった。これにより研究開発費40万円で、他部位への適用申請を行うことができました。

公共データベースを用いた研究例

例1

例2

過去眠っていたBiomarker Signatureについて公共データベースを用いて有用性を検証し、研究発展させ、現在PMDAの事前相談が終了し、診断薬申請を行っています。

例3

お見積り・ご注文について

ご依頼方法

jutaku@fujifilm.comまでご連絡をお願いいたします。
WEB面談で詳細なご要望を伺った後、お見積りをさせていただきます。

  • 掲載内容は本記事掲載時点の情報です。仕様変更などにより製品内容と実際のイメージが異なる場合があります。
  • 掲載されている製品について
    【試薬】
    試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
    試験研究用以外にご使用された場合、いかなる保証も致しかねます。試験研究用以外の用途や原料にご使用希望の場合、弊社営業部門にお問合せください。
    【医薬品原料】
    製造専用医薬品及び医薬品添加物などを医薬品等の製造原料として製造業者向けに販売しています。製造専用医薬品(製品名に製造専用の表示があるもの)のご購入には、確認書が必要です。
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