バイオインフォマティクス: 次世代シークエンス

SeqNova データ解析サービス

北海道システム・サイエンス株式会社

北海道システム・サイエンス株式会社では独自の「SeqNovaデータ解析 System」を構築し、次世代シーケンスデータをより有効にご活用頂ける解析サービスを併せてご提供しております。
実験系のご提案からその後の詳細なデータ処理までトータルサポートいたします。新規性の高い技術となりますので、ご希望の解析内容、実験目的などから最適な解析内容をご提案いたします。
ご遠慮なくご相談ください。

SeqNova LS(Large memory Server)

ゲノムサイズの大きな生物種のゲノム解析、自然環境のメタゲノム解析やメタトランスクリプトーム解析などでお困りではないですか?HSSでは次世代シーケンス解析のために大容量メモリを搭載した高機能サーバーを導入し、解析をお手伝いいたします。
次世代シーケンサーは、遺伝子発現解析、SNPなどの変異解析を行う上で非常に有効な解析ツールです。
しかし、ゲノム情報のない生物種のゲノム解析を行う場合、次世代シーケンサーから出力された短いリード配列を用いてゲノム配列の再構築をする必要があります(de novo アセンブル)。
de novo アセンブルはマッピングに比べて計算量が大きく、計算時間が長い上に大量のメモリを必要とします。
それは、de novo アセンブルを行うには全てのリード同士の組み合わせを網羅的に比較する必要があるためです。そのため、アセンブルの計算量は断片数と断片長に依存して増大していくため、ゲノムサイズの大きな生物種や多種生物ゲノムが混じった環境サンプルなどでは凄まじい計算量を要することになります。
弊社ではヒトサイズゲノム生物のde novo アセンブルを行うことが可能な国内最大級の解析サーバーをご用意して皆様のご利用をお待ちしております。

解析ご提供項目

下記○を提供しております。

ゲノムシーケンス ChIPシーケンス mRNAシーケンス small RNAシーケンス
マッピング
SNP候補検索
変異解析
頻度解析
de novoアセンブル
アノテーション付加
検体間比較
二次構造予測
専用ビューアー向けデータ加工

お見積り・ご注文について

ご依頼方法

下記のお見積り・ご注文フォームに必要事項をご記入の上ご連絡ください。

  • 掲載内容は本記事掲載時点の情報です。仕様変更などにより製品内容と実際のイメージが異なる場合があります。
  • 掲載されている製品について
    【試薬】
    試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
    試験研究用以外にご使用された場合、いかなる保証も致しかねます。試験研究用以外の用途や原料にご使用希望の場合、弊社営業部門にお問合せください。
    【医薬品原料】
    製造専用医薬品及び医薬品添加物などを医薬品等の製造原料として製造業者向けに販売しています。製造専用医薬品(製品名に製造専用の表示があるもの)のご購入には、確認書が必要です。
  • 表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
  • 表示している希望納入価格は本記事掲載時点の価格です。

受託サービスに関するお問合せ先

お問合せ窓口