eMD2 スタンダードアカデミック版 eMD2 Standard Academic Ed.

製造元 :: (株)インフォグラム

保存条件 :: 室温

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	販売元 303-17151 製造元 MD-AC1STD	1セット	見積り	照会

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概要	ダイナミック分子モデリングシステム eMD2 -Empowered MolecularDesign/Dynamics- eMD2(エムディースクエア)は、分子動力学シミュレーション(MD)計算と分子操作をリアルタイムに連携させた新しいタイプの分子モデリングソフトです。ユーザーフレンドリーなインターフェイスを通じ、通常のデスクトップコンピューター上で「分子間相互作用を実感しながら、''動く分子を使った分子モデリング''」が可能となりました。「よりリアルに、よりパワフルに、そして直感的に。」「よりリアルに、よりパワフルに、そして直感的に。」 ●動く分子をマニピュレーション現実に存在する分子は、分子振動・拡散など常に動いています。これらの分子ダイナミックスを考慮しなければ、現実の即した分子モデリングはできません。創薬開発におけるターゲットたんぱく質薬剤分子のドッキングシミュレーションでは、互いの分子間相互作用が考慮されなければなりません。現実の世界では、ターゲットたんぱく質や薬剤分子の構造はダイナミックに変化しています。これらがドッキングすることで互いの立体構造も変化するでしょう。これら全ての動きを考慮した分子モデリングによって、初めてリアリスティックな状態を直感的に把握できます。 ●力を感じる eMD2では、ユーザーによる分子操作中でも常にMD計算がリアルタイムに実行されています。このシミュレーションでは、各々の原子間に働く「力」が計算されています。ただ動いている分子を操作するだけでなく、この原子・分子にかかる力を実感することで、よりリアルな分子間操作が可能です。eMD2では、ユーザー設定によって、原子・分子が感じている力を、リアルタイムに表示します。またフォースフィードバック付入力デバイスを使えば、その力をリアルタイムに体感できます。原子・分子にかかる力の向きと大きさを直感的に認識することで、これまでの分子モデリングソフトでは得られなかった新しい視点・インスピレーションが生まれるでしょう。「分子の鼓動があなたの想像を刺激する」eMD2は、リアルな分子モデリングを提供します。 ●超高速MD計算(オプション) 独立行政法人理化学研究所で開発されたMDGRAPE-3は、2原子間のクーロン相互作用やレナードジョーンズポテンシャルなどを高速に計算するPC拡張ボードです。これをPCに搭載することで、通常のPCでも強力な分子動力学計算パワーが得られます。eMD2はこのボードとも連携可能であり、大規模なMD計算も高速に実行できます。eMD2とMDGRAPE-3を連携させた場合、MDGRAPE-3を使用しなかった場合と比べて、原子数12,967個の場合で154倍にもなります。これは5ヶ月かかった計算が1日で終わることを意味します。 (Wako Bio Window No.74, p23 (2006.4)) ダイナミック分子モデリングシステムeMD2 -Empowered Molecular Design/Dynamics-eMD 2(エムディースクエア)は、分子動力学シミュレーション(MD)計算と分子操作をリアルタイムに連携させた新しいタイプの分子モデリングソフトです。ユーザーフレンドリーなインターフェイスを通じ、通常のデスクトップコンピューター上で「分子間相互作用を実感しながら、''動く分子を使った分子モデリング''」が可能となりました。 (和光純薬時報 Vol.74 No.2, p25 (2006.4))

概要

ダイナミック分子モデリングシステム
eMD2 -Empowered MolecularDesign/Dynamics-
eMD2(エムディースクエア)は、分子動力学シミュレーション(MD)計算と分子操作をリアルタイムに連携させた新しいタイプの分子モデリングソフトです。ユーザーフレンドリーなインターフェイスを通じ、通常のデスクトップコンピューター上で「分子間相互作用を実感しながら、''動く分子を使った分子モデリング''」が可能となりました。「よりリアルに、よりパワフルに、そして直感的に。」「よりリアルに、よりパワフルに、そして直感的に。」
●動く分子をマニピュレーション
現実に存在する分子は、分子振動・拡散など常に動いています。これらの分子ダイナミックスを考慮しなければ、現実の即した分子モデリングはできません。創薬開発におけるターゲットたんぱく質薬剤分子のドッキングシミュレーションでは、互いの分子間相互作用が考慮されなければなりません。現実の世界では、ターゲットたんぱく質や薬剤分子の構造はダイナミックに変化しています。これらがドッキングすることで互いの立体構造も変化するでしょう。これら全ての動きを考慮した分子モデリングによって、初めてリアリスティックな状態を直感的に把握できます。
●力を感じる
eMD2では、ユーザーによる分子操作中でも常にMD計算がリアルタイムに実行されています。このシミュレーションでは、各々の原子間に働く「力」が計算されています。ただ動いている分子を操作するだけでなく、この原子・分子にかかる力を実感することで、よりリアルな分子間操作が可能です。eMD2では、ユーザー設定によって、原子・分子が感じている力を、リアルタイムに表示します。またフォースフィードバック付入力デバイスを使えば、その力をリアルタイムに体感できます。原子・分子にかかる力の向きと大きさを直感的に認識することで、これまでの分子モデリングソフトでは得られなかった新しい視点・インスピレーションが生まれるでしょう。「分子の鼓動があなたの想像を刺激する」eMD2は、リアルな分子モデリングを提供します。
●超高速MD計算(オプション)
独立行政法人理化学研究所で開発されたMDGRAPE-3は、2原子間のクーロン相互作用やレナードジョーンズポテンシャルなどを高速に計算するPC拡張ボードです。これをPCに搭載することで、通常のPCでも強力な分子動力学計算パワーが得られます。eMD2はこのボードとも連携可能であり、大規模なMD計算も高速に実行できます。eMD2とMDGRAPE-3を連携させた場合、MDGRAPE-3を使用しなかった場合と比べて、原子数12,967個の場合で154倍にもなります。これは5ヶ月かかった計算が1日で終わることを意味します。
(Wako Bio Window No.74, p23 (2006.4))
ダイナミック分子モデリングシステムeMD2 -Empowered Molecular Design/Dynamics-eMD 2(エムディースクエア)は、分子動力学シミュレーション(MD)計算と分子操作をリアルタイムに連携させた新しいタイプの分子モデリングソフトです。ユーザーフレンドリーなインターフェイスを通じ、通常のデスクトップコンピューター上で「分子間相互作用を実感しながら、''動く分子を使った分子モデリング''」が可能となりました。
(和光純薬時報 Vol.74 No.2, p25 (2006.4))

物性情報

「物性情報」は参考情報でございます。規格値を除き、この製品の性能を保証するものではございません。
本製品の品質及び性能については、本品の製品規格書をご確認ください。
なお目的のご研究に対しましては、予備検討を行う事をお勧めします。

製造元情報

別名一覧