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Veritas・cBio mRNA-seq受託解析キャンペーン最大70%OFF、30名限定!! キャンペーン期間:2023年12月1日~2024年3月31日

Veritas・cBio mRNA-seq受託解析キャンペーン最大70%OFF、30名限定!! キャンペーン期間:2023年12月1日~2024年3月31日

次世代シーケンス受託解析キャンペーン①

キャンペーン期間 2023年12月1日(金) ~ 2024年3月31日(日)

ご好評につき、20名の枠を追加いたしました。(30名限定+20名!!)
2月中旬までサンプルご提出で年度内納品にまだ間に合います!

TotalRNAでご提出いただき、ライブラリー調製~データ解析まで

シーケンスまでは、Veritas社で行い、解析は国内のcBioinformatics社で実施いたします。

● mRNA-Seq(150bp PE, PolyA精製)

データ量 リード数(ペアエンドリード) 希望納入価格 キャンペーン価格
6G 2,000万リード ¥80,000/検体 ¥25,000/検体
  • シーケンスまでの作業日数:Veritas社に検体到着後20営業日
  • データ解析の作業日数:10~15営業日
  • 10検体以上のご依頼とさせていただきます。

解析内容 RNA-seq Basic planでは、Fastq fileからカウントデータの取得、クラスター解析、変動遺伝子取得、ヒートマップの作成、Gene enrichment解析に加え、転写因子の推定を素早く解析させていただきます。データの全体の概要を眺め、外れサンプルの推定など専門性の高い解析をご提供いたします。
結果はリンク付きのレポートで、見易くファイルを検索する手間がありません。
さらに深い解析や個別のadvancedな解析(免疫特化など)もご案内可能です。

提出検体推奨条件

● RNA検体

サンプルの状態 タンパク質除去・Dnase処理後のTotal RNA OD260/280 1.8~2.2 備考 サンプルには有機物やたんぱく質の混入がないものとする
(ナノドロップでの測定を推奨)
RNA量 ≥2 μg OD260/230 1.8~2.2
容量 ≥10 μL 28S: 18S ≥1.2
濃度 ≥100 ng/μL RIN ≥7
※ご提出いただく検体が、推奨条件を満たさない場合は、お問い合わせください。
  • シーケンスは、NovaSeq6000を使用して行います。
  • 検体は弊社からVeritas社へ発送しますが、発送に別途1~2週間ほど必要です。
  • 中国へ発送したサンプルは、返却することができません。

1. 発現変動遺伝子の検出

コントロールサンプルと比べた遺伝子発現量を統計的に検定し、発現上昇遺伝子および発現低下遺伝子の検出を行います。

2. エンリッチメント解析(GO, Pathway)

コントロール群に対して比較群が発現上昇している(もしくは発現低下している)遺伝子を塊でみたときに、 どのような意味合いがあるのかを統計学的に検定します。

3. 転写因子予測解析(ヒト, マウス, ショウジョウバエのみ)

発現変動遺伝子群に共通して見られる転写因子結合モチーフの探索を行い、マスター遺伝子の推定を行います。

(1) 転写因子結合領域の共通モチーフの探索

■ 依頼前にWEB面談で解析内容の詳細についてご説明も可能ですので、ご興味のある場合は、jutaku@fujifilm.comまでご連絡をお願いいたします。
■ お客様向けの説明会も随時受付中です。

次世代シーケンス受託解析キャンペーン②

キャンペーン期間 2023年12月1日(金) ~ 2024年3月31日(日)

TotalRNAでご提出QCチェック~ライブラリ調製シーケンスカウントデータ取得解析ソフトウェア納品

シーケンスまでは、Veritas社で行い、解析ソフトウェア納品は国内のcBioinformatics社で実施いたします。

6検体の場合 : ¥20,000 × 6 + ¥5,000 × 6 + ¥50,000 = ¥200,000

● mRNA-Seq(150bp PE, PolyA精製)

シーケンス費用

データ量 リード数(ペアエンドリード) 希望納入価格 キャンペーン価格
6G 2,000万リード ¥80,000/検体 ¥20,000/検体

カウントデータ取得費用

希望納入価格 キャンペーン価格
¥8,000/検体 ¥5,000/検体

ソフトウェア費用

希望納入価格 キャンペーン価格
¥150,000 ¥50,000
  • シーケンスまでの作業日数:Veritas社に検体到着後20営業日
  • カウントデータ取得~解析ソフトウェア納期:10営業日
  • 6検体以上で2群(n=3以上)のご依頼とさせていただきます。
    例)コントロール群3検体、比較群3検体の計6検体のご依頼
  • 解析ソフトウェアは、5か月間使用可能です。

提出検体推奨条件

● RNA検体

サンプルの状態 タンパク質除去・Dnase処理後のTotal RNA OD260/280 1.8~2.2 備考 サンプルには有機物やたんぱく質の 混入がないものとする
(ナノドロップでの測定を推奨)
RNA量 ≥2 μg OD260/230 1.8~2.2
容量 ≥10 μL 28S: 18S ≥1.2
濃度 ≥100 ng/μL RIN ≥7
※ご提出いただく検体が、推奨条件を満たさない場合は、お問い合わせください。
  • シーケンスは、NovaSeq6000を使用して行います。
  • 検体は弊社からVeritas社へ発送しますが、発送に別途1~2週間ほど必要です。
  • 中国へ発送したサンプルは、返却することができません。

cBioinformatics社が提供する Socratesは、マウス操作のみでRNA-seqの解析が簡単にできるソフトウェアです。お客様のFastq fileから取得したカウントデータをソフトウェアへ読み込ませた状態で納品いたします。
WEB上でユーザー名とパスワードを入力後、すぐに解析を開始することが出来ます。

解析できる内容 クラスター解析、変動遺伝子取得、ヒートマップの作成、エンリッチメント解析(GO, Pathwey)解析結果の図は、そのまま論文に掲載も可能で、外れ値のサンプルを除いた再解析もすぐに実行可能です。
解析ソフトウェアのデモも可能ですので、ご興味がある方はご連絡をお願いいたします。

※ソフトウェアのみの販売も可能です。

解析ソフトウェアSOCRATESの機能の説明

cBioinformaticsでは研究者の意図が解析へそのまま反映されることが研究遂行上重要なプロセスと考えます。
アイディアや修正を思いついた時に、すぐに結果を得ることも重要と考えています。
Socratesは複雑なプログラミングは不要で、操作も簡単なので、DRY解析が初めての方でも簡単に解析が可能です。

サンプルのフィルタリング

サンプルを条件に合わせて、フィルタリングします。
例えば薬剤Aを加えたサンプル、薬剤Bを加えたサンプルなどの条件下で、薬剤Aを加えたサンプルのみを対象にしたい場合、簡単にフィルタリングが可能です。

データの外観を眺める

データの外観を眺めることは解析上重要なステップになります。クラスタリングによってデータの外観を眺めて、デザインが上手くいっているのか、外れサンプルがないかをチェックしていきます。

発現変動遺伝子の推定

比較デザインを決定して(例えば薬剤A群 vs 薬剤B)、 変動遺伝子の推定を行います。変動遺伝子の推定は2群比較のみならず、多群にも対応しています。カットオフ値を変えてもすぐに結果が得られます。

Gene Enrichment解析

推定された発現変動遺伝子を元に、生物学的な意味合いを推定していく解析になります。GO解析、Pathway解析が可能です。

Figure作成

得られた結果を視覚的に確認し、Figure作成を行います。
Figureはすぐにダウンロードが可能で、論文投稿にも使用が可能です。

■ 依頼前にWEB面談で解析内容の詳細についてご説明も可能ですので、ご興味のある場合は、jutaku@fujifilm.comまでご連絡をお願いいたします。
■ お客様向けの説明会も随時受付中です。

次世代シーケンス受託解析キャンペーン③

キャンペーン期間 2023年12月1日(金) ~ 2024年3月31日(日)

ライブラリー調製~シーケンスまでの価格表

● mRNA-Seq(150bp PE, PolyA精製)

+30,000円/検体、納期+5営業日でライブラリー調製方法をrRNA除去法に変更可能!

データ量 リード数(ペアエンドリード) 希望納入価格 キャンペーン価格
3G 1,000万リード ¥45,000/検体 ¥22,500/検体
6G 2,000万リード ¥60,000/検体 ¥30,000/検体
9G 3,000万リード ¥75,000/検体 ¥37,500/検体
12G 4,000万リード ¥90,000/検体 ¥45,000/検体
※作業日数:Veritas社に検体到着後20営業日

提出検体推奨条件

● RNA検体

サンプルの状態 タンパク質除去・Dnase処理後のTotal RNA OD260/280 1.8~2.2 備考 サンプルには有機物やたんぱく質の 混入がないものとする
(ナノドロップでの測定を推奨)
RNA量 ≥2 μg OD260/230 1.8~2.2
容量 ≥10 μL 28S: 18S ≥1.2
濃度 ≥100 ng/μL RIN ≥7
※ご提出いただく検体が、推奨条件を満たさない場合は、お問い合わせください。
  • シーケンスは、NovaSeq6000を使用して行います。
  • 上記のデータ量は、一例となりますので1G単位で変更可能です。
  • 1検体からご利用いただけます。
  • mRNA-seqでは、ストランド特異的シーケンスも選択可能です。
  • 上記に記載のないシーケンスも割引価格でご提供いたします。
  • データはFastq形式でクラウドまたはHDD納品(+¥20,000・追加納期1週間)となります。
    *解析が必要な場合は、裏面のcBioinformatics社のサービスをご提供しております。
  • 検体は弊社からVeritas社へ発送しますが、発送に別途2週間ほど必要です。
  • 中国へ発送したサンプルは、返却することができません。

見積依頼方法

下記内容を記載の上、jutaku@fujifilm.com までご連絡をお願いいたします。

① 解析種:例)mRNA-seq ② 検体数:例)6検体 ③ 提出検体:例)ライブラリー調製済検体、Total RNA、DNA
④ 生物種:例)ヒト、バクテリア ⑤ データ量:例)6G ⑥ご利用代理店

Socrates 希望納入価格 ¥150,000 ▶ キャンペーン価格 ¥127,500

※カウントデータ取得費用が別途発生します。希望納入価格 ¥8,000/検体 ▶ キャンペーン価格 ¥6,800/検体
ライセンス有効期間は通常3ヶ月のところ、キャンペーン期間中に限り5ヶ月まで延長

cBioinformatics社が提供する Socratesは、マウス操作のみでRNA-seqの解析が簡単にできるソフトウェアです。お客様のFastq fileから取得したカウントデータをソフトウェアへ読み込ませた状態で納品いたします。WEB上でユーザー名とパスワードを入力後、すぐに解析を開始することが出来ます。

解析内容 クラスター解析、変動遺伝子取得、ヒートマップの作成、エンリッチメント解析(GO, Pathwey) 解析結果の図は、そのまま論文に掲載も可能で、外れ値のサンプルを除いた再解析もすぐに実行可能です。
解析ソフトウェアのデモも可能ですので、ご興味がある方はご連絡をお願いいたします。

見積依頼方法

下記内容を記載の上、jutaku@fujifilm.com までご連絡をお願いいたします。

代表が、臨床医 兼 バイオインフォマティシャンですので、臨床的な解釈と幅広いバイオインフォマティクスの知識、生物学に関する高い研究力が魅力のサービスです

RNA-seq解析Basic plan 希望納入価格 ¥20,000/検体  ▶ キャンペーン価格¥17,000/検体

解析内容 RNA-seq Basic planでは、Fastq fileからカウントデータの取得、クラスター解析、変動遺伝子取得、ヒートマップの作成、Gene enrichment解析に加え、転写因子の推定を素早く解析させていただきます。データの全体の概要を眺め、外れサンプルの推定など専門性の高い解析をご提供いたします。
結果はリンク付きのレポートで、見易くファイルを検索する手間がありません。
さらに深い解析や個別のadvancedな解析(免疫特化など)もご案内可能です。

1. 発現変動遺伝子の検出

コントロールサンプルと比べた遺伝子発現量を統計的に検定し、発現上昇遺伝子および発現低下遺伝子の検出を行います。

2. エンリッチメント解析(GO, Pathway)

コントロール群に対して比較群が発現上昇している(もしくは発現低下している)遺伝子を塊でみたときに、 どのような意味合いがあるのかを統計学的に検定します。

3. 転写因子予測解析(ヒト, マウス, ショウジョウバエのみ)

発現変動遺伝子群に共通して見られる転写因子結合モチーフの探索を行い、マスター遺伝子の推定を行います。

(1) 転写因子結合領域の共通モチーフの探索

■ 依頼前にWEB面談で解析内容の詳細についてご説明も可能ですので、ご興味のある場合は、jutaku@fujifilm.comまでご連絡をお願いいたします。
■ お客様向けの説明会も随時受付中です。