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Veritas社・cBioinformatics社 次世代シーケンス受託解析

次世代シーケンス受託サービスキャンペーン 期間 2021年6月14日~2021年9月30日

次世代シーケンス受託サービスキャンペーン

キャンペーン価格(ライブラリー調整~シーケンス)

最大50%OFF

mRNA-Seq(PolyA精製)

サービス名 データ量 リード数 (ペアエンドリード) 希望納入価格 キャンペーン価格
mRNA-seq (150bp PE) 3G 1,000万リード ¥45,000/検体 ¥22,500/検体
6G 2,000万リード ¥60,000/検体 ¥30,000/検体
9G 3,000万リード ¥75,000/検体 ¥37,500/検体
12G 4,000万リード ¥90,000/検体 ¥45,000/検体

※作業日数:Veritas社に検体到着後20営業日

mRNA-Seq(rRNA除去法)

サービス名 データ量 リード数 (ペアエンドリード) 希望納入価格 キャンペーン価格
mRNA-seq (150bp PE) 6G 2,000万リード ¥90,000/検体 ¥60,000/検体
9G 3,000万リード ¥105,000/検体 ¥67,500/検体
12G 4,000万リード ¥120,000/検体 ¥75,000/検体

※作業日数:Veritas社に検体到着後25営業日

Small RNA-seq

サービス名 データ量 リード数 (シングルリード) 希望納入価格 キャンペーン価格
Small RNA-seq (50bp SE) 0.5G 1,000万リード ¥65,000/検体 ¥50,000/検体

※作業日数:Veritas社に検体到着後25営業日

全エクソームシーケンス WES(ヒト or マウス)

サービス名 データ量 カバレッジ 希望納入価格 キャンペーン価格
全エクソ-ム解析 (150bp PE) 6G 100×カバレッジ相当 ¥80,000/検体 ¥50,000/検体
12G 200×カバレッジ相当 ¥115,000/検体 ¥72,500/検体

※作業日数:Veritas社に検体到着後20営業日

全ゲノムシーケンス WGS

サービス名 データ量 カバレッジ 希望納入価格 キャンペーン価格
ゲノム解析 (150bp PE) 90G 30xカバレッジ相当 (ヒトの場合) ¥178,000/検体 ¥160,000/検体

※作業日数:Veritas社に検体到着後20営業日

  • NovaSeq6000を使用してシーケンスを行います。
  • データはFastqデータでクラウド納品となります。
    *HDD納品も可能ですが、別途費用(20,000円)と追加納期(1週間程度)が発生します。
  • 検体は弊社からVeritas社へ発送しますが、発送に別途2~3週間ほど必要です。
  • 提出いただいた検体の返却はできませんので、予めご了承ください。
  • 上記ラインナップに記載のないシーケンスについては、お問合せをお願いいたします。

検体推奨条件

DNA検体

サンプルの状態 タンパク質除去・RNase 処理後のゲノム DNA
DNA 量 ≥2 μg
容量 40 µg
濃度 ≥50 ng/μL (Qubitでの測定を推奨)
OD260/280 1.8~2.2
OD260/230 1.8~2.2
備考 アガロースゲル電気泳動にてgDNAに分解がないことを確認することを推奨。
サンプルには有機物やタンパク質の混入がないものとする (ナノドロップでの測定を推奨)

RNA検体

サンプルの状態 タンパク質除去・DNase 処理後の Total RNA
RNA 量 ≥2 μg
容量 ≥10 μL
濃度 ≥100 ng/μL
OD260/280 1.8~2.2
OD260/230 1.8~2.2
28S:18S ≥1.2
RIN ≥7
備考 サンプルには有機物やタンパク質の混入がないものとする (ナノドロップでの測定を推奨)。

ライブラリー調製キット

Veritas社では下記のライブラリー調製キットを使用しております。

  • 全ゲノムシーケンス: KAPA Library Prep Kits for Illumina
  • ヒト全エクソームシーケンス:SureSelect Human All Exon V6
  • マウス全エクソームシーケンス:Sureselect mouse all exon kit
  • mRNA-Seq (polyA精製):NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit for Illumina
  • mRNA-Seq(rRNA除去法):TruSeq Stranded Total RNA Library Prep+NEB Next® Ultra RNA Library Prep Kit for Illumina
  • Small RNA-Seq:NEBNext® Multiplex Small RNA Library Prep Set

見積依頼方法

下記メールアドレスに下記項目をご連絡ください。
jutaku@fujifilm.com

  • ご希望のシーケンス種類
  • ご希望の取得データ量
  • 生物種
  • 検体数
  • ライブラリー調製の有無
  • 解析の有無

RNAseq 解析 Basic plan

RNA seq Basic planでは、Fastq fileからカウントデータの取得、変動遺伝子取得、Gene enrichment解析に加え、転写因子の推定を素早く解析させていただきます。データの全体の概要を眺め、外れサンプルの推定など専門性の高い解析をご提供致します。

サービス名 データ量 希望納入価格 キャンペーン価格
mRNA-seq:Basic Plan 6 G ¥20,000/検体 ¥17,000/検体

その他解析やデータ量についてはお問合せください。

Basic plan解析内容詳細

クラスター解析

データ全体の概要を眺めることは重要です。
左の例では研究デザインがうまくいっている場合と外れサンプルがある例を示しています。
下記の外れサンプルはraw dataに立ち返るとサンプルの状態が非常に悪いことが判明しました。
データ解析で初めてわかるクオリティーがあります。
正確なデータ概要の把握はデータ解析を進めていく上で重要なステップになります。主成分分析も同じくです。

発現変動遺伝子解析

変動遺伝子解析はRNAseqの基本で、醍醐味でもあります。
変動遺伝子は統計学的な推定の基づき行われます。
Fold change, FDR, p.valueを参考に変動遺伝子の決定をしていきます。データの外観やサンプル数、変動遺伝子数を考慮し、後に続く解析でより意義のある解析を行うために適切なカットオフ値を設定し解析を進めていくことで意義のある結果が得られます。

Gene enrichment解析

変動遺伝子解析で得られた遺伝子を塊りとして生物学的な意義をつけていく初めのStepとしてGene enrichment 解析があります。
Gene ontologyやpathway解析を行い変動遺伝子がどのような生物学的変化を示していくのか?
解釈や仮説を立てていいくガイドとしてGene enrichment解析は有効な手段となります。
Globalな解析からポイントを絞った解析へと移行するワクワク感を伴う解析ともいえます。

Transcription factor binding motif enrichment 解析

遺伝子発現は複雑なネットワークの制御の中で見えるスナップショットなデータです。
遺伝子の発現の制御を行う転写因子について解析を行うのがTranscription factor binding motif enrichment解析です。
弊社では転写因子に関するデータベース依存型の解析に加え、変動遺伝子のpromoter領域の特定の配列パターンに結合する転写因子の推定を行います。Gene enrichment 解析と合わせて結果を解釈することでより深い解析が可能となります。

見積依頼方法

下記メールアドレスに下記項目をご連絡ください。
jutaku@fujifilm.com

  • ご希望のシーケンス種類
  • ご希望の取得データ量
  • 生物種
  • 検体数
  • ライブラリー調製の有無
  • 解析の有無